Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPBP1Q92547 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms