Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG3Q8WXD2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms