Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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SETD9Q8NE22 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SETD9Q8NE22 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SETD9Q8NE22 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SETD9Q8NE22 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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