Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTC29Q8NA56 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms