Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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