Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms