Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms