Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBRM1Q86U86 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms