Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms