Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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