Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms