Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms