Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms