Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT80Q6KB66 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT80Q6KB66 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms