Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms