Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms