Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC92Q53HC0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms