Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms