Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC184Q52MB2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms