Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP41Q3LFD5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms