Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC96Q2M329 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms