Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms