Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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