Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAM2Q15035 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms