Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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