Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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