Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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