Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPA4Q13156 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPA4Q13156 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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