Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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