Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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