Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms