Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTP4A2Q12974 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTP4A2Q12974 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTP4A2Q12974 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTP4A2Q12974 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PTP4A2Q12974 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PTP4A2Q12974 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PTP4A2Q12974 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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