Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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