Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCB1Q12824 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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