Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC8Q09428 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms