Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms