Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGALS3BPQ08380 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms