Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms