Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms