Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBQ06643 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBQ06643 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms