Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms