Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms