Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms