Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCDQ05655 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms