Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms