Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC6Q03468 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms