Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms