Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC10Q01780 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms