Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTCQ00610 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms