Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHC1P78364 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHC1P78364 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHC1P78364 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHC1P78364 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHC1P78364 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHC1P78364 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHC1P78364 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHC1P78364 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHC1P78364 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHC1P78364 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms